Практическая биоинформатика

Linux1. Как устроены команды в Linux

LINUX7. Как редактировать файлы при помощи команды sed

Statistics 1 - введение в статистику. Описательные статистики

NF5. Как устроены каналы в Nextflow, как создавать каналы

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по ПЦР и RNAseq (магистры)

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по биоинформатике (магистры)

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по биохимии (бакалавры)

NF6. Методы для работы с каналами в Nextflow

NF8. Раздел input в процессе Nextflow

Statistics 3 - алгоритм статистического вывода на примере теста Стьюдента. Что такое p-value

NF10. Как соединять процессы в Nextflow при помощи каналов

NF3. Основные типы данных Groovy

NF4. Установка Nextflow

Statistics 5 - ограничения теста Стьюдента. Тест Велча

NF11. Как использовать директивы процессов Nextflow

Statistics 6 - Непараметрические тесты. Тест Манна-Уитни и Вилкоксона

Snakemake 2: дополнительные возможности при написании пайплайнов

MB4. Как подбирать праймеры для ПЦР

Python-9. Как работает цикл for в python

Statistics 2 - статистика вывода. Распределения в статистике

NF2. Как устроен язык для написания пайплайнов Nextflow

LINUX14. Как устанавливать программы при помощи conda

NF1. Что такое пайплайны и зачем они нужны

2 ноября - О Нобелевской премии за исследование эволюции человека методами палеогенетики

Python-14. Как использовать lambda-функции в python

MB3. Как решать задачи на ПЦР

MB2 . Как решать задачи на приготовление растворов

Python-2. Как настроить Jupyter Notebook

Прогнозирование третичной структуры белка в AlphaFold // Егор Мустаев

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по ПЦР и RNAseq (бакалавры)

BD8. Как искать и анализировать 3D структуру белка

PyNTO4. Как решать задачи на поиск таргетной последовательности при помощи python

Python-1. Введение, выбор интерактивной среды разработки (IDE)

LINUX2. Как использовать команды для навигации в Linux

BD15. Разбор задачи финала магистров олимпиады Я-профессионал 2021 года

Python-11. Как создать функцию в python

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по молекулярной биологии (бакалавры)

Геномное секвенирование: как и зачем?

Python-6. Типы данных в python: словари

28 декабря 2022 - Ручная реконструкция потоковых моделей метаболических систем

Python-7. Типы данных в python: множество

Python-13. Изменяемые и неизменяемые типы данных в python

Bcftools: поиск и фильтрация генетических вариантов

LINUX9. Как писать и запускать скрипты в Linux

LINUX10. Как автоматизировать выполнение команд при помощи скриптов на bash

Linux15. Как устроены и зачем нужны контейнеры Singularity

Conda: установка и основные команды

RNA-Seq1. Как анализировать данные RNA-seq

Биоинженерия и биоинформатика: разбор задачи финала 2024 по молекулярной биологии (магистры)

NF9. Раздел Output процессов Nextflow

LINUX8. Как анализировать файлы при помощи команд cut и sort