Посетите мою мастерскую http://maximaster.by/
1 - Сначала устанавливаем на первый HDD Windows. Я использовал 50% пространства для С:/ диска.
2 - На второй HDD (предварительно отключив первый) я установил Steam OS автоматической установкой.
3 - Подключил оба HDD и установил UBUNTU 15.10
В итоге у меня в одном блоке Steam Machines, PC и Linux - это вкратце. Подробно смотрите в ролике...