Misją NAWA jest wspieranie wymiany i współpracy międzynarodowej, w celu wzmocnienia potencjału polskiej nauki i szkolnictwa wyższego. Umiędzynarodowienie nie jest celem samym w sobie, ale narzędziem świadomie wykorzystywanym do wspierania doskonałości naukowej, wzmocnienia jakości edukacji czy też zaangażowania społecznego polskich uniwersytetów i instytucji badawczych, wpisując się tym samym w strategiczne cele Państwa.