Utilisation de cBioPortal pour les analyses NGS
Tutoriel de présentation de l'outil en ligne cBioPortal, qui permet d'explorer, visualiser et analyser des données de génomiques de type ADN, ARN, protéines, qui proviennent de multiples études dont les données ont été mis à disposition de la communauté scientifique.
Formateur : Marc Deloger, Institut Curie, Inserm U900, Mines ParisTech.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Accéder à l'outil : http://www.cbioportal.org
Le Cancéropôle Île-de-France a mis en place un groupe de travail "bio-informatique et cancer" qui réunit des chercheurs des institutions franciliennes impliquées dans ce domaine. Les réflexions de ce groupe de travail ont conduit à l'organisation de formations pratiques par le Cancéropôle Île-de-France. Ce tutoriel vidéo a été réalisé dans le cadre de cette formation et vise à apporter des notions de base sur le traitement des données à haut-débit et sa mise en pratique sous Galaxy.