Salah satu faktor yang mempengaruhi sarana dan prasarana pendidikan yang kurang merata di sekolah adalah kurangnya koordinasi antara pemerintah pusat dan pemerintah daerah, terkadang proses pengawasan dan pengontrolan pendidikan yang dilakukan pemerintah pusat tidak menjangkau daerah-daerah yang terpencil seperti Papua.